Kvaliteta vode ima važan utjecaj na akvakulturu. Stoga je posebno važno za akvakulturu da bude upoznata s pokazateljima detekcije, da provodi redovite inspekcije kvalitete vode i da pravovremeno reagira na prilagodbu pokazatelja kvalitete vode.
Glavne stavke za ispitivanje voda za akvakulturu uključuju pH, amonijev dušik, otopljeni kisik, nitrite, sulfide i salinitet. Među njima, otopljeni kisik i odgovarajući pH su bitni uvjeti, dok su amonijev dušik, nitritni dušik i sulfid glavne otrovne tvari koje proizvode metabolizam riba i škampa. Točno i pravovremeno mjerenje koncentracije tih tvari, a zatim poduzimanje odgovarajućih mjera može uvelike poboljšati stopu preživljavanja riba i škampa te smanjiti troškove uzgoja.