წყლის ხარისხს მნიშვნელოვანი გავლენა აქვს აკვაკულტურაზე. ამიტომ, განსაკუთრებით მნიშვნელოვანია აკვაკულტურისთვის, რომ იცნობდეს აღმოჩენის ინდიკატორებს, რეგულარულად ატარებდეს წყლის ხარისხის შემოწმებას და დროულად რეაგირებდეს წყლის ხარისხის ინდიკატორების კორექტირებაზე.
აკვაკულტურის წყლების ძირითადი ტესტირების პუნქტებია pH, ამიაკის აზოტი, გახსნილი ჟანგბადი, ნიტრიტი, სულფიდი და მარილიანობა. მათ შორის, გახსნილი ჟანგბადი და სათანადო pH აუცილებელი პირობებია, ხოლო ამიაკის აზოტი, ნიტრიტის აზოტი და სულფიდი თევზისა და კრევეტების მეტაბოლიზმის შედეგად წარმოქმნილი ძირითადი ტოქსიკური ნივთიერებებია. ამ ნივთიერებების კონცენტრაციის ზუსტი და დროული გაზომვა და შემდეგ შესაბამისი ზომების მიღება მნიშვნელოვნად აუმჯობესებს თევზისა და კრევეტების გადარჩენის მაჩვენებელს და ამცირებს მოშენების ხარჯებს.