Vannkvalitet har en viktig innvirkning på akvakultur. Derfor er det spesielt viktig for akvakultur å være kjent med deteksjonsindikatorene, å gjennomføre regelmessige vannkvalitetsinspeksjoner og å reagere på justeringer av vannkvalitetsindikatorene i tide.
De viktigste testpunktene for akvakulturvann inkluderer pH, ammoniakknitrogen, oppløst oksygen, nitritt, sulfid og saltinnhold. Blant disse er oppløst oksygen og riktig pH viktige betingelser, mens ammoniakknitrogen, nitrittnitrogen og sulfid er de viktigste giftstoffene som produseres av fisk og reker. Nøyaktig og rettidig måling av konsentrasjonen av disse stoffene, og deretter iverksettelse av tilsvarende tiltak, kan forbedre overlevelsesraten for fisk og reker betraktelig og redusere kostnadene ved avl.