Kvalitet vode ima važan utjecaj na akvakulturu.Stoga je za akvakulturu posebno važno da bude upoznata s indikatorima detekcije, da provodi redovne inspekcije kvaliteta vode, te da pravovremeno reagira na prilagođavanje indikatora kvaliteta vode.
Glavne stavke za ispitivanje vode za akvakulturu uključuju pH, amonijačni dušik, otopljeni kisik, nitrit, sulfid i salinitet.Među njima, otopljeni kisik i odgovarajući pH su bitni uvjeti, dok su amonijačni dušik, nitrit dušik i sulfid glavne toksične tvari koje stvaraju metabolizam ribe i škampa.Precizno i pravovremeno mjerenje koncentracije ovih supstanci, a potom i poduzimanje odgovarajućih mjera može značajno poboljšati stopu preživljavanja riba i škampa, te smanjiti troškove uzgoja.