کیفیت آب تأثیر مهمی بر آبزی پروری دارد.بنابراین، آشنایی آبزی پروری با شاخص های تشخیص، انجام بازرسی های منظم کیفیت آب و پاسخگویی به موقع به تنظیم شاخص های کیفیت آب از اهمیت ویژه ای برخوردار است.
موارد اصلی آزمایش برای آبهای آبزی پروری شامل pH، نیتروژن آمونیاکی، اکسیژن محلول، نیتریت، سولفید و شوری است.در این میان، اکسیژن محلول و PH مناسب شرایط ضروری هستند، در حالی که نیتروژن آمونیاکی، نیتروژن نیتریت و سولفید مواد سمی اصلی تولید شده توسط متابولیسم ماهی و میگو هستند.اندازه گیری دقیق و به موقع غلظت این مواد و سپس انجام اقدامات مربوطه می تواند میزان بقای ماهی و میگو را تا حد زیادی بهبود بخشد و هزینه های پرورش را کاهش دهد.