Kvaliteta vode ima važan utjecaj na akvakulturu.Stoga je za akvakulturu osobito važno poznavati detekcijske pokazatelje, provoditi redovite preglede kakvoće vode te pravodobno reagirati na prilagodbu pokazatelja kakvoće vode.
Glavne stavke ispitivanja vode za akvakulturu uključuju pH, amonijačni dušik, otopljeni kisik, nitrit, sulfid i salinitet.Među njima, otopljeni kisik i pravilan pH bitni su uvjeti, dok su amonijačni dušik, nitritni dušik i sulfid glavne otrovne tvari koje proizvodi metabolizam riba i račića.Točno i pravodobno mjerenje koncentracije ovih tvari, a potom i poduzimanje odgovarajućih mjera može uvelike poboljšati stopu preživljavanja riba i račića, te smanjiti troškove uzgoja.