Kualiti air mempunyai kesan penting terhadap akuakultur.Oleh itu, amat penting bagi akuakultur untuk membiasakan diri dengan penunjuk pengesanan, menjalankan pemeriksaan kualiti air secara berkala, dan bertindak balas terhadap pelarasan penunjuk kualiti air tepat pada masanya.
Item ujian utama untuk perairan akuakultur termasuk pH, nitrogen ammonia, oksigen terlarut, nitrit, sulfida, dan kemasinan.Antaranya, oksigen terlarut dan pH yang betul adalah syarat penting, manakala nitrogen ammonia, nitrogen nitrit dan sulfida adalah bahan toksik utama yang dihasilkan oleh metabolisme ikan dan udang.Pengukuran kepekatan bahan-bahan ini yang tepat dan tepat pada masanya, dan kemudian mengambil langkah-langkah yang sepadan boleh meningkatkan kadar kemandirian ikan dan udang, dan mengurangkan kos pembiakan.