Jakość wody ma istotny wpływ na akwakulturę.Dlatego dla akwakultury szczególnie ważna jest znajomość wskaźników wykrywalności, prowadzenie regularnych kontroli jakości wody oraz terminowe reagowanie na dostosowanie wskaźników jakości wody.
Główne elementy testowe wód akwakultury obejmują pH, azot amonowy, rozpuszczony tlen, azotyny, siarczki i zasolenie.Spośród nich rozpuszczony tlen i odpowiednie pH są niezbędnymi warunkami, podczas gdy azot amonowy, azot azotanowy i siarczki są głównymi substancjami toksycznymi wytwarzanymi w metabolizmie ryb i krewetek.Dokładny i terminowy pomiar stężenia tych substancji, a następnie podjęcie odpowiednich działań może znacznie poprawić przeżywalność ryb i krewetek oraz obniżyć koszty hodowli.