Квалитет воде има важан утицај на аквакултуру.Због тога је за аквакултуру посебно важно да буде упозната са индикаторима детекције, да спроводи редовне инспекције квалитета воде и да благовремено реагује на прилагођавање индикатора квалитета воде.
Главне ставке за испитивање воде за аквакултуру укључују пХ, амонијачни азот, растворени кисеоник, нитрит, сулфид и салинитет.Међу њима, растворени кисеоник и одговарајући пХ су есенцијални услови, док су амонијачни азот, нитритни азот и сулфид главне токсичне супстанце које производе метаболизам рибе и шкампа.Прецизно и благовремено мерење концентрације ових супстанци, а затим предузимање одговарајућих мера може значајно побољшати стопу преживљавања риба и шкампа и смањити трошкове узгоја.