Vandkvaliteten har en vigtig indflydelse på akvakultur. Derfor er det særligt vigtigt for akvakultur at være bekendt med detektionsindikatorerne, at udføre regelmæssige vandkvalitetsinspektioner og at reagere rettidigt på justeringer af vandkvalitetsindikatorerne.
De vigtigste testpunkter for akvakulturvand omfatter pH, ammoniaknitrogen, opløst ilt, nitrit, sulfid og saltindhold. Blandt disse er opløst ilt og korrekt pH-værdi essentielle betingelser, mens ammoniaknitrogen, nitritnitrogen og sulfid er de vigtigste giftige stoffer, der produceres af fisk og rejers metabolisme. Nøjagtig og rettidig måling af koncentrationen af disse stoffer og derefter passende foranstaltninger kan forbedre overlevelsesraten for fisk og rejer betydeligt og reducere omkostningerne ved opdræt.